《屠杀器官》的舞台将设定在赛拉耶佛核爆后的地球，此时部分落后国家爆发了一连串内战及民族冲突，在这血腥风暴之中，美国特殊情报部队「克拉维斯（クラヴィス）」发现了在阴影之下有一名叫「约翰?保罗（ジョン?ポール）」的美国人参与其中，约翰路过之处必定掀起腥风血雨，这让众人疯狂的「屠杀器官」到底是什么变相怪杰国语版　　剧场版动画《屠杀器官》根据早逝的天才科幻小说作家伊藤计划的同名小说改编，由富士电视台的...

　　应届大学毕业生森美咲（早见沙织饰），因为父母早年过世，现和经营面包店的姐姐和姐夫一家生活。而她现在正在美国白宫前参观旅游。一切都很正常，直到咲她被卷入一场冲突事件，所幸被解救下来，而拯救他的英雄却是个一丝不挂，全身上下只有手机一件物品的奇怪男子。而该男子不幸还失忆了，只知道他的名字是泷泽朗（木村良平饰）。而这个叫做朗的奇异男子只是所有事情的一个序幕。咲的世界观至此被颠覆，一堆疑问在她面前亟待解...