世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛...

　　大雄最近一段时间经常被奇怪的梦困扰，接着，他房间中央的榻榻米下面还不断出现响动。某天，榻榻米被撞开，里面跑出一个像兔子一样的生物。它的名字叫恰米，是外星男孩罗布姆的宠物。罗布姆和亲人、朋友生活在名为可亚可亚的星球，这里盛产奇妙的浮游矿石。邪恶的浮游矿石工业公司为了霸占这些矿藏，不惜使用各种卑鄙手段企图将罗布姆这群早期开拓者赶走。罗布姆乘坐的飞船就是遭到浮游矿石工业的袭击，偶然引发错乱和大雄的房...