新婚夫妇菜奈（原田知世饰）和翔太（田中圭饰）搬进了公寓的新房，幸福甜蜜的两人对新生活充满期待。搬家当天公寓要开居民会，菜奈猜拳输给了翔太，便独自前去参加围棋少年第三部全集　　除会长早苗（木村多江饰）、管理人床岛（竹中直人饰）以外，还有田宫（生濑胜久饰）、黑岛（西野七濑饰）等共十三人参加了居民会。闲聊时，床岛一句“谁都有想杀某个人的瞬间”让众人虽有些犹豫但还是纷纷谈论起恨不得他死的那个人，接着话...

　　一个全身闪红光的哥斯拉在香港登陆，并把港岛和九龙的繁荣商业区破坏後离去。及後东京海底队道亦因为隧道机械主轴溶化不停发生事故，原来哥斯拉身上的冷却系统已破坏，令牠体内核子分裂快速活性化，并变成一座懂得步行的核子厂。同时东京水族馆发生谜一样的事件—水族馆内的鱼被离奇杀害，经研究後发现是一些生活在二亿多年前的地层生物—狄斯亚所造成。在临海副都心，自卫队派出冷冻战车迎战不明生物—狄斯亚及哥斯拉。此时哥...